Starou zeminu vyvezte a použijte při založení kompostu a do skleníku navezte nový substrát. Volba nového substrátu zaleží na vašich možnostech. Vždy doporučujeme zároveň s výměnou provést základní hnojení. Ideální je zralý koňský nebo kravský hnůj, nebo zralý kompost v kombinaci s fosforečnatými a draselnými hnojivy. Pěstebním substrátem může být ornice, kompostní zemina, nebo zahradnický substrát. Před výsevy a výsadbou je vhodné důkladně vyčistit skla a ostatní plochy (police, cestičky,…), tak aby se co nejvíce snížil počet choroboplodných zárodků a přezimujících škůdců.